Vandamálapunkturinn miðað við gagnaöryggi á meðan EPUB-skjöl eru breytt í PDF felst í óvissu notandans um hvort gögnin hans eru vernduð á meðan ferlinu stendur. Þar sem mörg tæki, forrit og forritsstikur styðja ekki EPUB-sniðið, er nauðsynlegt að nota umbreytingartól. Geta hins vegar kvíði myndast hvort gögnin sem eru sett fram, sérstaklega ef þau eru viðkvæm eða trúnaðarmál, eru örugg á meðan tólið er notað. Það geta kvíða myndast að aðilar þriðju aðila gætu fengið aðgang að gögnunum eða notað þau aftur án samþykkis notandans. Þetta getur hins vegar leitt til þess að notendur hika við að nota slíkt tól, þótt það sé í raun haglelegur lausn á vandamál þeirra.

EPUB í PDF-tól PDF24 býður upp á áreiðanlega og örugga lausn til að breyta EPUB-skjölum í PDF. Það tryggir verndað ferli þar sem notandagögn eru örugg og leggur því mikinn stein til persónuverndar. Tólið tryggir að upplýsingarnar sem eru veittar verði ekki dreift til þriðju aðila eða notaðar án samþykkis notandans á meðan um breytingu er að ræða. Gagnaleynd er tryggð með nútímalegum öryggisprotokollum og dulmálstöknun. Þannig geta notendur óhætt breytt trúnaðarmálum og viðkvæmum efni. EPUB í PDF-tól PDF24 tryggir öruggan, fljótlegan og háfjölda breytingarferil sem skilar notanda öryggisleik. Með þessari lausn geta notendur breytt EPUB-skjölum sínum í þátt skráarsnið sem þeir vilja án þess að setja gagnaleynd sína í hættu.