Sunkumai, susiję su duomenų apsauga naudojant PDF24 įrankius ODG failų paverčiant į PDF formatą internetu, yra verti dėmesio. Kyla klausimas, ar naudojant šį įrankį duomenys yra saugūs ir ar perduodant gali būti pakliusios jautrios informacijos. Ypač dideliam duomenų apsaugos reikalavimui, naudotojai turi būti tikri, kad jų failai bus ištrinti iš serverių tik baigus konvertavimą. Galimybė keisti nustatymus ir sujungti kelis ODG failus, nors tai ir patogu, tačiau gali kelti duomenų apsaugos problemas. Todėl ypač svarbu, kad PDF24 įrankiai skaidriai pateiktų savo saugos priemones, siekiant pašalinti galimus naudotojų duomenų apsaugos rūpesčius.

PDF24 Tools labai daug dėmesio skiria savo vartotojų saugumui ir duomenų apsaugai. Visos įkeltos ir konvertuotos bylos po baigtos konvertacijos automatiškai ištrinamos iš serverių, siekiant apsaugoti konfidencialią informaciją. Be to, duomenų perdavimo metu naudojamos pažangios šifravimo technologijos, kurios nepalieka vietos duomenų apsaugos pažeidimams. Be to, naudojant šį įrankį nereikia asmeninių duomenų, tai užtikrina vartotojų anonimiškumą. Galimybė pritaikyti nustatymus taip pat yra valdoma atsižvelgiant į griežtas duomenų apsaugos taisykles. Todėl šis įrankis gali būti naudojamas laikantis aukščiausių duomenų apsaugos standartų, saugiai konvertuojant ODG bylas į PDF. PDF24 Tools skaidrumas ir atvirumas dėl jų saugumo priemonių skatina pasitikėjimą ir vartotojų pasitenkinimą.