Probleemi tuum peitub privaatsusega seotud muredest, mis tulenevad PDF-failide konverteerimise online-tööriistade kasutamisest PDFA vormingusse. Erilist ettevaatlikkust nõuavad konfidentsiaalsed dokumendid, mis tuleb üles laadida ja konverteerida, kuna need salvestatakse ajutiselt välisesse serverisse. On oht, et volitamata isikud võivad neile failidele juurde pääseda. Lisaks pole andmekustutusprotsessid pärast konverteerimist alati läbipaistvad ja on ebakindlust, kas andmed eemaldatakse tegelikult täielikult. Lõpuks on mure ka selle pärast, et isiklikke andmeid, mida tööriista kasutamise ajal kogutakse, võivad pakkuja kasutada muudel eesmärkidel või need edasi anda.

PDF-i PDFA-ks teisendamise tööriist käsitleb neid privaatsusprobleeme, rakendades rangeid turvameetmeid. See kasutab turvalist ühendust (HTTPS) failide üleslaadimiseks ja allalaadimiseks, välistades igasuguse välimise juurdepääsu failidele. Pärast konverteerimisprotsessi lõpetamist kustutatakse kõik üleslaaditud failid automaatselt ja pöördumatult serverist. Need kustutamistoimingud on selgelt määratletud ja läbipaistvad, andes kasutajatele kindlustunde, et ühtegi andmeid ei jää alles. Lisaks ei kogu tööriist oma kasutamise ajal kasutajate isikuandmeid ega edasta teavet kolmandatele isikutele. Seega tagatakse turvaline, usaldusväärne ja privaatne kasutus.