समस्या स्थिति वेब टूल्स के उपयोग से उत्पन्न होने वाली डेटा सुरक्षा चिंताओं पर केंद्रित होती है, जिनका उपयोग पीडीएफ फ़ाइलों को पीडीएफए फ़ॉर्मैट में परिवर्तित करने के लिए किया जाता है। विशेष रूप से संवेदनशील यह होता है, जब गोपनीयता पूर्ण दस्तावेज़ों को अपलोड और परिवर्तित किया जाना चाहिए, क्योंकि ये अस्थायी रूप से एक बाहरी सर्वर पर संग्रहीत होते हैं। यह खतरा होता है कि अनधिकृत तीसरे पक्ष इन फ़ाइलों तक पहुंच सकते हैं। साथ ही, परिवर्तन के बाद डेटा मिटाने की प्रक्रियाएं हमेशा पारदर्शी नहीं होती हैं और असुरक्षितता होती है कि क्या डेटा सचमुच पूरी तरह हटा दिया जाता है। अंत में, चिंता यह भी होती है कि व्यक्तिगत डेटा, जो टूल के उपयोग के दौरान एकत्र किया जाता है, उसे प्रदाताओं द्वारा अन्य उद्देश्यों के लिए उपयोग किया जा सकता है या उन्हें आगे दिया जा सकता है।

PDF से PDFA कन्वर्ट करने का टूल डाटा सुरक्षा सम्बंधित चिंताओं को सख्त सुरक्षा उपायों के कार्यान्वयन के माध्यम से संबोधित करता है। यह एक सुरक्षित कनेक्शन (HTTPS) का उपयोग करता है फ़ाइल अपलोड और डाउनलोड के लिए, जो बाहरी पहुंच को फ़ाइलों पर रोकता है। कन्वर्शन प्रक्रिया पूरी होने के बाद, सभी अपलोड की गई फ़ाइलें स्वचालित रूप से और अपरिवर्तनीय रूप से सर्वर से हटा दी जाती हैं। ये डिलीट करने की क्रियाएं साफ और पारदर्शी होती हैं, जो उपयोगकर्ताओं को निश्चितता देती हैं कि कोई भी डाटा बाकी नहीं रहता है। इसके अलावा, टूल का उपयोग करते समय उपयोगकर्ताओं की किसी व्यक्तिगत जानकारी का संग्रहण नहीं करता है और किसी तीसरे पक्ष को भी कोई जानकारी नहीं देता है। इस प्रकार, सुरक्षित, विश्वसनीय और निजी उपयोग की गारंटी दी जाती है।